Eötvös Loránd Tudományegyetem
Természettudományi Kar
Fizikai Intézet

 
   

 

 

 

 

 

mesterszakos diplomatéma részletei

LEZÁRVA!

A kiíró adatai
Név: Szöll?si Gergely János
Tudományos fokozat: PhD
Intézet: Fizika Intézet, Biológiai Fizika Tanszék 1117 Pázmány Péter stny. 1A
Telefonszám: 06307253532
Honlap: http://angel.elte.hu/~ssolo

 

A mesterszakos diplomatéma:
Címe: Methods for the construction of species tree-aware homologous gene families
A munka jellege: kísérleti és elméleti
Szakterületi besorolás: Biológiai Fizika
A téma rövid leírása: The advent of efficient and cost effective sequencing technologies has resulted in a flood of genomic data, which has revolutionised our understanding of the Tree of Life at all scales. The starting point for phylogenetic analysis of genomic data consists of groups of putatively homologous genes, called gene families. State of the art methods for the construction of homologous gene families rely on ad hoc clustering approaches and completely ignore any prior information on the species phylogeny, despite the potentially highly informative nature of species level relationships.

We will explore methods for the construction of species tree-aware homologous gene families, by combining existing approaches for homologous clustering with probabilistic gene tree-species tree reconciliation methods and ancestral sequence reconstruction.
Szükséges előismeretek: phylogenomics
Egyetemi konzulens:
Tanszék: Biológiai Fizika Tanszék

 

 

 

Programozás és grafika:
Pozsgai Péter